На протяжении всей жизни Степан Григорьевич Бархударов участвовал в подготовке учебников по русскому языку, разрабатывал научные основы преподавания русского языка. Он рецензировал и редактировал учебники и пособия для нерусских, консультировал составителей методических писем и программ. Являлся инициатором создания и ответственным редактором журнала "Русский язык в национальной школе", членом редколлегии журнала "Русский язык за рубежом", ответственным редактором журнала "Русский язык в школе". Его научные интересы затрагивают вопросы лексикологии и лексикографии, грамматики, словообразования, истории русского языка, истории русского языкознания, пунктуации. Составленный им орфографический словарь на 106 тысяч слов, а также "Словарь древнерусского языка" (XI-XII вв.) имеют огромную теоретическую и практическую ценность, а его многочисленные труды по древнерусской орфографии и лексике стали настольными пособиями для исследователей русского языка во всем мире.